Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MTSS1O43312 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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