Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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