Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms