Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB23Q9ULC3 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RAB23Q9ULC3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms