Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
POLKQ9UBT6 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms