Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms