Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMOD4Q9NZQ9 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms