Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 HOXB-AS1-203ENST00000504972 680 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms