Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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