Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGCZQ96LD1 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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