Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLIP4Q8N3C7 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLIP4Q8N3C7 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLIP4Q8N3C7 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLIP4Q8N3C7 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLIP4Q8N3C7 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLIP4Q8N3C7 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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