Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LRRC38Q5VT99 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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LRRC38Q5VT99 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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LRRC38Q5VT99 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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LRRC38Q5VT99 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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LRRC38Q5VT99 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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LRRC38Q5VT99 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRC38Q5VT99 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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