Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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