Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC011509.2-201ENST00000592263 627 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC019322.2-201ENST00000605634 147 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 Z83838.1-201ENST00000431036 925 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms