Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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COL4A6Q14031 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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