Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms