Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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