Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms