Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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