Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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