Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 PRDM10-205ENST00000526082 3308 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 AC159540.2-202ENST00000613749 2830 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 MUSK-204ENST00000374440 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 TRPC3-201ENST00000264811 3675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 LY9-203ENST00000368037 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 CLIP1-214ENST00000540539 2592 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC080188.1-201ENST00000491923 567 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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