Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms