Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms