Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CENPFP49454 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CENPFP49454 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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