Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms