Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SALL4Q9UJQ4 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SALL4Q9UJQ4 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SALL4Q9UJQ4 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SALL4Q9UJQ4 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SALL4Q9UJQ4 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SALL4Q9UJQ4 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SALL4Q9UJQ4 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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