Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms