Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB9BQ9NP90 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms