Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRHQ9HD43 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRHQ9HD43 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRHQ9HD43 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRHQ9HD43 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRHQ9HD43 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRHQ9HD43 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms