Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
WDR53Q7Z5U6 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
WDR53Q7Z5U6 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
WDR53Q7Z5U6 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
WDR53Q7Z5U6 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
WDR53Q7Z5U6 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms