Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms