Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC004803.1-202ENST00000545629 569 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms