Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYTH1Q15438 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms