Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms