Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NCF4Q15080 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCF4Q15080 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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