Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms