Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms