Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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SYNE4Q8N205 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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SYNE4Q8N205 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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SYNE4Q8N205 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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SYNE4Q8N205 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SYNE4Q8N205 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SYNE4Q8N205 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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