Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms