Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTCH1Q13635 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTCH1Q13635 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTCH1Q13635 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTCH1Q13635 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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