Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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