Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CHRDL1-203ENST00000394797 2413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CCDC129-202ENST00000407970 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CAST-213ENST00000504465 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ARMC8-215ENST00000471453 2910 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 L3MBTL3-203ENST00000368139 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC02090-201ENST00000419151 400 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 IKZF2-202ENST00000374319 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ALG13-204ENST00000436609 3812 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZNF583-202ENST00000333201 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FASTKD2-202ENST00000402774 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MAPK10-240ENST00000639175 2596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL136981.1-201ENST00000411450 549 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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