Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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