Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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