Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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HOXD8P13378 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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