Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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