Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms