Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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