Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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