Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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